ЛАБОРАТОРИЯ ЭПИГЕНЕТИКИ
Организована в 2002 году.
РУКОВОДИТЕЛЬ: д.б.н., профессор, действительный член РАЕН Дмитрий Владимирович Залетаев
НАУЧНЫЙ ПЕРСОНАЛ:
Немцова Марина Вячеславовна – в.н.с., д.б.н., профессор
Стрельников Владимир Викторович – в.н.с., к.б.н., доцент
Бабенко Ольга Владимировна – в.н.с., к.б.н.
Кузнецова Екатерина Борисовна – с.н.с., к.б.н.
Землякова Валерия Владимировна – н.с., к.б.н.
Михайленко Дмитрий Сергеевич – с.н.с., к.м.н.
Кекеева Татьяна Владимировна - н.с., к.м.н.
Сухорукова Мария Владимировна – н.с.
Танас Александр Сергеевич – н.с.
Бабаян Анна Юрьевна – ординатор
Шкарупо Виктория Владимировна – ординатор
..
Еще в 1993 г., в рамках лаборатории клинической цитогенетики, образовалась группа единомышленников, начавших, благодаря финансовой поддержке Российской программы «Геном человека», разработку молекулярно-генетических подходов к диагностике синдромов Прадера-Вилли, Ангельмана, Мартина-Белл. Ими так же уделялось большое внимание исследованиям микроделеционных синдромов, молекулярно-генетической характеристике минимальных районов перекрывания делеций, картированию трихо-рино-фаланговых синдромов и множественной экзостозной болезни. С 1999 г. группа начала исследования эпигенетической патологии в злокачественных опухолях и, вместе с этим, разработку диагностических процедур для синдромальных форм раковых заболеваний (ретинобластома, опухоль Вилмса-аниридия, множественные эндокринные неоплазии). Организатором группы, а затем руководителем первой в России лаборатории эпигенетики стал доктор биологических наук, профессор Д.В. Залетаев.
Основные направления исследований.
Молекулярные основы наследственной патологии сегодня являются наиболее изучаемой проблемой медицинской и молекулярной генетики. Развитие этой области науки в последние годы показало, что расшифровка нуклеотидной последовательности является только одним из первых шагов к пониманию закономерностей функционирования генома в целом. Изучение структурно-функциональной организации определенных хромосомных районов, модификаций ДНК и функции «концерта генов» в норме и при патологии выходит на одно из первых мест.
Явления импринтинга, эффекта положения и структурно-функциональной организации хроматина в конкретном хромосомном локусе определяют характер экспрессии генов. Изменения в экспрессии гена без каких-либо соответствующих структурных нарушений в его нуклеотидной последовательности классифицируются как эпигенетические. Механизмами такой патологии являются аномалии метилирования промоторных и регуляторных областей гена, динамические (амплификация микросателлитных повторов) и точковые мутации в регуляторных областях генов, транспозиции повторяющихся элементов генома. В последнее время, в качестве причин возникновения некоторых генетических и онкологических заболеваний, все большая роль отводится эпигенетической регуляции активности генов, основанной на аномальном метилировании CpG-островков в промоторных районах, что приводит к их полной инактивации.
Одним из основных направлений деятельности лаборатории является исследование структурно-функциональной организации хромосомных участков, повреждение которых вызывает синдромальные формы МВПР. Особое внимание уделяется микроделеционным синдромам, заболеваниям, связанным с импринтингом и динамическими мутациями. В рамках этого направления проводится характеристика спектра молекулярной патологии и разработка диагностических протоколов.
Второе направление связано с исследованием молекулярных механизмов канцерогенеза и, в первую очередь, исследованием эпигенетических механизмов регуляции экспрессии генов. Основное внимание уделяется поиску и характеристике молекулярных маркеров, имеющих диагностическое и прогностическое значение. Мы выделяем несколько основных аспектов: молекулярная диагностика наследственных форм рака, поиск и характеристика маркеров неблагоприятного прогноза, диагностика микрометастазов, поиск и характеристика молекулярных маркеров канцерогенеза на до- симптоматической стадии заболевания. Основным результатом этих исследований являются диагностические протоколы, позволяющие повысить качество диагностики и эффективность лечения. В рамках этого направления проводятся исследования стромально-мезенхимных взаимодействий, исследования клонального происхождения опухолей и их рецидивов.
Третий раздел исследований связан с анализом полиморфных вариантов ДНК, увеличивающих риск развития широко распространенных заболеваний, в частности, онкологических. Кроме того, проводятся исследования полиморфизмов ДНК, определяющих эффективность лекарственных препаратов. Результаты этих исследований могут и должны улучшить качество жизни и здоровье населения.
Еще одним направлением исследований является поиск причин мужского и женского бесплодия, в частности, характеристика полиморфных вариантов ДНК, осложняющих беременность, характеристика неслучайной инактивации Х-хромосомы и др. Исследование анеуплоидий и эпигенетических нарушений на ранних стадиях (до бластоцисты) развития эмбриона и неразвивающихся беременностей.
Коллектив лаборатории владеет всеми современными методами анализа нуклеиновых кислот. В частности, в качестве рутинных, используются методы анализа точковых мутаций (SSCP, анализ гетеродуплексов, прямое секвенирование), микроделеций, потери гетерозиготности и косвенной ДНК-диагностики (микросателлитный анализ, анализ однонуклеотидных полиморфизмов, фрагментный анализ), функциональных нарушений (метил-чувствительная и метил-специфическая ПЦР, метил-специфическое секвенирование, метил-чувствительный фингерпринтинг, ОТ-ПЦР, ПЦР в реальном времени).
Награды лаборатории:
Премия Координационного Межведомственного Совета по приоритетному направлению «Науки о жизни и биотехнология» за лучшую научную работу по ГНТП России «Геном человека» за 1995 г. (Д.В. Залетаев)
Государственная научная стипендия 1997-2000 гг. по специальности «Физиология и фундаментальные проблемы медицины». (Д.В. Залетаев)
Премия им. академика А.А. Баева в рамках Федеральной целевой НТП «Геном человека» 1997 г. (Д.В. Залетаев)
Премия Координационного Межведомственного Совета по приоритетному направлению «Науки о жизни и биотехнология» за лучшую научную работу по ГНТП России «Геном человека» за 1998 г. (В.В. Стрельников)
Премия Координационного Межведомственного Совета по приоритетному направлению «Науки о жизни и биотехнология» за лучшую научную работу по ГНТП России «Геном человека» за 1999 г. (Д.В. Залетаев)
Серебряная медаль РАЕН «За развитие медицины и здравоохранения». 1999 г. (Д.В. Залетаев)
Первая премия Президиума РАМН за научную работу «Комплексный анализ изменений критических районов хромосом и разработка протоколов ДНК-диагностики» за 2001 г. (Д.В. Залетаев, М.В. Немцова)
Золотая медаль и премия Первого международного салона инноваций и инвестиций за разработку «Онкогеномика – практической медицине». Москва, ВВЦ, февраль 2001 г. (Д.В. Залетаев и соавторы)
Премия Международной академической издательской компании «Наука/Интерпериодика» за лучший цикл публикаций в журнале «Молекулярная биология», 2005 г. (Д.В. Залетаев, М.В. Немцова, В.В. Стрельников, О.В. Бабенко, В.В. Землякова, Е.В. Васильев, В.В. Артамонов)
Премия Европейского общества генетиков человека за лучшую научную работу молодых ученых. Амстердам 2006. (В.В. Стрельников)
Лучшая научная работа в области онкологии. XI Российский онкологический конгресс. Москва, ноябрь 2007 г. (Д.С. Михайленко, Д.В. Залетаев и др.)
Премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники для молодых ученых 2009 года за работу «Разработка и внедрение методов ДНК-диагностики для раннего определения и прогноза некоторых онкологических заболеваний» удостоены Д.С.Михайленко, Т.В.Кекеева и Д.В.Залетаев (в качестве руководителя).
ОСНОВНЫЕ ПУБЛИКАЦИИ:
1. Strelnikov V.V., Nemtsova M.V., Chesnokova G.G., Kuleshov N.P., Zaletayev D.V. A simple multiplex FRAXA, FRAXE and FRAXF PCR assay convenient for wide screening programs.// Human Mutation. – 1999. – № 2. – P.166–169.
2. О.В. Бабенко, С.В. Саакян, А.Ф. Бровкина, В.М. Козлова, М.В. Немцова, Д.В. Залетаев. Спектр и частота структурной патологии гена RB1 при ретинобластоме // Молекулярная биология. – 2001. – Т. 36, №4. – С. 623–629.
3. В.В. Землякова, В.В. Стрельников, И.Б. Зборовская, О.В. Балукова, О.А. Майорова, Е.В.Васильев, Д.В. Залетаев, М.В. Немцова. Сравнительный анализ аномального метилирования CpG-островков, расположенных в промоторных областях генов p16/CDKN2А и р14/ARF при немелкоклеточном раке легкого и остром лимфобластном лейкозе // Молекулярная биология. – 2004. – Т. 38, № 6. – С. 966–972.
4. Е.В. Васильев, П.О. Румянцев, В.А. Саенко, А.А. Ильин, Е.Ю. Полякова, М.В. Немцова, Д.В. Залетаев. Молекулярный анализ структурных нарушений генома папиллярных карцином щитовидной железы // Молекулярная биология. – 2004. – Т. 38, № 4. – С. 642–653.
5. Д.В. Залетаев, М.В. Немцова, В.В. Стрельников, О.В.Бабенко, Е.В.Васильев, В.В. Землякова, А.И. Жевлова, О.В. Дрозд. Диагностика эпигенетической патологии при наследственных и онкологических заболеваниях. // Молекулярная биология. – 2004. – Т. 38, № 2. – С. 213–223.
6. Е.В.Кузнецова, Т.В. Кекеева, С.С. Ларин, В.В. Землякова, О.В.Бабенко, М.В.Немцова, Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Новые маркеры метилирования и экспрессии генов при раке молочной железы // Молекулярная биология. – 2007. – Т. 41, № 4. – С.624–633.
7. Т.В. Кекеева, О.П. Попова, П.В. Шегай, Б.Я. Алексеев, Ю.Ю. Андреева, Д.В. Залетаев, М. В. Немцова. Аномальное метилирование генов-супрессоров опухолевого роста Р16, HIC1, N33 и GSTP1 в опухолевом эпителии и стромальных клетках предстательной железы // Молекулярная биология. – 2007. – Т. 41, № 1. – С.79–85.
8. EB Kuznetsova, TV Kekeeva, SS Larin, VV Zemlyakova, AV Khomyakova, OV Babenko, MV Nemtsova, DV Zaletayev, VV Strelnikov. Methylation of the BIN1 gene promoter CpG island associated with breast and prostate cancer // J Carcinog. – Jan 2007. – №6. – P.9.
9. Д. С. Михайленко, Р. В. Курынин, А. М. Попов, О. Б. Карякин, М. Э. Еникеев, Ю. Г. Аляев, М. В. Немцова, Д. В. Залетаев. Инактивация гена VHL при спорадическом светлоклеточном раке почки // Молекулярная биология. – 2008. – Т. 42, № 1. – С.71-77.
10. Alexander S Tanas, Viktoria V Shkarupo, Ekaterina B Kuznetsova, Dmitry V Zaletayev, Vladimir V Strelnikov. Novel tools for unbiased DNA differential methylation screening. Epigenomics, 2010, Vol. 2, No. 2, Pages 325-333
Контакты:
Тел./факс: 622-9635
zalnem@online.ru
|
